W 1870 r. biskup Adelajdy Laurence Sheil nałożył na MacKillop ekskomunikę. Media ujawniły właśnie, że jej powodem była nie tyle - jak ogłosił biskup - niesubordynacja zakonnicy, ile jej zaangażowanie przeciw skandalowi pedofilskiemu. Dzieci wykorzystywał seksualnie ks. Patrick Keating. Na skutek interwencji MacKillop został on wysłany do rodzinnej Irlandii jako "alkoholik". Przyjaciel księdza z zemsty lobbował u biskupa (skutecznie) za wykluczeniem zakonnicy z Kościoła. Bp Sheil później karę jednak cofnął jako niekanoniczną.Wątek ów w historii MacKillop ma dużą siłę rażenia - przypomina, że ofiary pedofilii potrzebują od Kościoła pomocy. Geoffrey Robinson, biskup pomocniczy Sydney w latach 1984-2004, przewodniczący komisji episkopatu do wyjaśniania przypadków nadużyć, odkrył wyparty z pamięci dramat własnego dzieciństwa, kiedy padł ofiarą pedofilii. Koszmar powrócił do niego...